MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 5417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011738	GAC	2	6	371	376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442612
2	NC_011738	ATA	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442612
3	NC_011738	ACC	2	6	659	664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442612
4	NC_011738	TA	4	8	672	679	50 %	50 %	0 %	0 %	218442612
5	NC_011738	TTATCT	2	12	717	728	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218442612
6	NC_011738	TAA	2	6	786	791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442612
7	NC_011738	CACTC	2	10	1315	1324	20 %	20 %	0 %	60 %	218442613
8	NC_011738	TCTCT	2	10	1517	1526	0 %	60 %	0 %	40 %	218442613
9	NC_011738	AGA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442613
10	NC_011738	AAT	2	6	1537	1542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442613
11	NC_011738	T	6	6	1551	1556	0 %	100 %	0 %	0 %	218442613
12	NC_011738	ATC	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
13	NC_011738	TC	3	6	1997	2002	0 %	50 %	0 %	50 %	218442614
14	NC_011738	T	6	6	2046	2051	0 %	100 %	0 %	0 %	218442614
15	NC_011738	CCT	2	6	2052	2057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442614
16	NC_011738	ATCC	2	8	2061	2068	25 %	25 %	0 %	50 %	218442614
17	NC_011738	ATT	2	6	2077	2082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442614
18	NC_011738	T	6	6	2176	2181	0 %	100 %	0 %	0 %	218442614
19	NC_011738	T	6	6	2194	2199	0 %	100 %	0 %	0 %	218442614
20	NC_011738	TCA	2	6	2249	2254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
21	NC_011738	ACT	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
22	NC_011738	CCT	2	6	2327	2332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442614
23	NC_011738	ATC	4	12	2392	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
24	NC_011738	CGA	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442614
25	NC_011738	CT	3	6	2606	2611	0 %	50 %	0 %	50 %	218442614
26	NC_011738	TAC	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
27	NC_011738	TGA	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442614
28	NC_011738	TCA	2	6	2808	2813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
29	NC_011738	GGC	2	6	2919	2924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442614
30	NC_011738	ATC	2	6	2978	2983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
31	NC_011738	GTA	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442614
32	NC_011738	GCT	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442614
33	NC_011738	TCC	2	6	3082	3087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442614
34	NC_011738	ATT	2	6	3107	3112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442614
35	NC_011738	TCT	2	6	3155	3160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442614
36	NC_011738	TAA	2	6	3291	3296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442614
37	NC_011738	GAT	2	6	3325	3330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442614
38	NC_011738	AAT	2	6	3491	3496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442614
39	NC_011738	GTT	2	6	3501	3506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442614
40	NC_011738	CATCC	2	10	3507	3516	20 %	20 %	0 %	60 %	218442614
41	NC_011738	TCT	3	9	3588	3596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442614
42	NC_011738	ATA	2	6	3658	3663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442614
43	NC_011738	TTC	2	6	3715	3720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442614
44	NC_011738	CGAT	2	8	3774	3781	25 %	25 %	25 %	25 %	218442614
45	NC_011738	TAG	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442614
46	NC_011738	GGAG	2	8	3832	3839	25 %	0 %	75 %	0 %	218442614
47	NC_011738	AAG	2	6	3920	3925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442614
48	NC_011738	TCT	3	9	3929	3937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442614
49	NC_011738	TCA	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442614
50	NC_011738	TTTG	2	8	4035	4042	0 %	75 %	25 %	0 %	218442614
51	NC_011738	GCT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442614
52	NC_011738	G	6	6	4148	4153	0 %	0 %	100 %	0 %	218442614
53	NC_011738	CCG	2	6	4217	4222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442614
54	NC_011738	CCACT	2	10	4302	4311	20 %	20 %	0 %	60 %	218442614
55	NC_011738	CT	3	6	4422	4427	0 %	50 %	0 %	50 %	218442614
56	NC_011738	TGG	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442614
57	NC_011738	T	6	6	4479	4484	0 %	100 %	0 %	0 %	218442614
58	NC_011738	CCAA	2	8	4527	4534	50 %	0 %	0 %	50 %	218442614
59	NC_011738	ATT	2	6	4538	4543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442614
60	NC_011738	AT	3	6	4544	4549	50 %	50 %	0 %	0 %	218442614
61	NC_011738	ATG	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442614
62	NC_011738	T	6	6	4603	4608	0 %	100 %	0 %	0 %	218442614
63	NC_011738	ATA	2	6	4645	4650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442614
64	NC_011738	TTG	2	6	4672	4677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442614
65	NC_011738	CAA	2	6	4738	4743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442614
66	NC_011738	CCT	2	6	4780	4785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442614
67	NC_011738	CT	3	6	4867	4872	0 %	50 %	0 %	50 %	218442614
68	NC_011738	CCG	2	6	4875	4880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442614
69	NC_011738	A	6	6	4975	4980	100 %	0 %	0 %	0 %	218442614
70	NC_011738	CGG	2	6	5032	5037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442614
71	NC_011738	TGAA	2	8	5169	5176	50 %	25 %	25 %	0 %	218442614
72	NC_011738	GTT	2	6	5186	5191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442614
73	NC_011738	ATT	2	6	5876	5881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442615
74	NC_011738	GA	3	6	5908	5913	50 %	0 %	50 %	0 %	218442615
75	NC_011738	ATT	2	6	5938	5943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442615
76	NC_011738	ATCCC	2	10	6247	6256	20 %	20 %	0 %	60 %	218442616
77	NC_011738	T	6	6	6283	6288	0 %	100 %	0 %	0 %	218442616
78	NC_011738	AGT	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442616
79	NC_011738	TTAA	2	8	6305	6312	50 %	50 %	0 %	0 %	218442616
80	NC_011738	TAA	2	6	6330	6335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442616
81	NC_011738	AAT	2	6	6442	6447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442616
82	NC_011738	ACT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442616
83	NC_011738	TCT	2	6	6493	6498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442616
84	NC_011738	TAA	2	6	6546	6551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442616
85	NC_011738	CGTCT	2	10	6618	6627	0 %	40 %	20 %	40 %	218442616
86	NC_011738	TTC	2	6	6715	6720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442616
87	NC_011738	TA	3	6	6729	6734	50 %	50 %	0 %	0 %	218442616
88	NC_011738	TTGA	2	8	6738	6745	25 %	50 %	25 %	0 %	218442616
89	NC_011738	CTT	2	6	6774	6779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442616
90	NC_011738	CAA	2	6	6795	6800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442616
91	NC_011738	T	6	6	6895	6900	0 %	100 %	0 %	0 %	218442616
92	NC_011738	GAA	2	6	6989	6994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442616
93	NC_011738	TTC	2	6	7084	7089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442616
94	NC_011738	T	7	7	7158	7164	0 %	100 %	0 %	0 %	218442616
95	NC_011738	ATGGTA	2	12	7238	7249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442616
96	NC_011738	ATA	2	6	7250	7255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442616
97	NC_011738	TCT	2	6	7276	7281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442616
98	NC_011738	AAT	2	6	7311	7316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442616
99	NC_011738	CAAATT	2	12	7560	7571	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218442617
100	NC_011738	AAT	2	6	7638	7643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442617
101	NC_011738	ATC	2	6	7647	7652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442617
102	NC_011738	TAAA	2	8	7667	7674	75 %	25 %	0 %	0 %	218442617
103	NC_011738	TGG	2	6	7885	7890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442617
104	NC_011738	AAAG	2	8	7944	7951	75 %	0 %	25 %	0 %	218442617
105	NC_011738	CGC	2	6	7969	7974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442617
106	NC_011738	GTC	2	6	8034	8039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442617
107	NC_011738	TTA	2	6	8086	8091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442617
108	NC_011738	TGG	2	6	8622	8627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442618
109	NC_011738	ATG	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
110	NC_011738	GGC	2	6	8646	8651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442618
111	NC_011738	ATT	2	6	8699	8704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442618
112	NC_011738	CGATT	2	10	8750	8759	20 %	40 %	20 %	20 %	218442618
113	NC_011738	AGA	2	6	8786	8791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442618
114	NC_011738	CTT	3	9	8820	8828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442618
115	NC_011738	AATT	2	8	8855	8862	50 %	50 %	0 %	0 %	218442618
116	NC_011738	ATT	2	6	8873	8878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442618
117	NC_011738	TCGA	2	8	8888	8895	25 %	25 %	25 %	25 %	218442618
118	NC_011738	C	7	7	8917	8923	0 %	0 %	0 %	100 %	218442618
119	NC_011738	TGA	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
120	NC_011738	T	6	6	9032	9037	0 %	100 %	0 %	0 %	218442618
121	NC_011738	T	6	6	9047	9052	0 %	100 %	0 %	0 %	218442618
122	NC_011738	TGA	2	6	9064	9069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
123	NC_011738	GATGA	2	10	9073	9082	40 %	20 %	40 %	0 %	218442618
124	NC_011738	AAC	2	6	9216	9221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442618
125	NC_011738	TGA	2	6	9222	9227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
126	NC_011738	TTG	2	6	9264	9269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442618
127	NC_011738	TA	3	6	9320	9325	50 %	50 %	0 %	0 %	218442618
128	NC_011738	GAT	2	6	9380	9385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442618
129	NC_011738	ATT	2	6	9396	9401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442618
130	NC_011738	GCT	2	6	9409	9414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442618
131	NC_011738	TCA	2	6	9465	9470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442618
132	NC_011738	AT	3	6	9481	9486	50 %	50 %	0 %	0 %	218442618
133	NC_011738	ATTAG	2	10	9714	9723	40 %	40 %	20 %	0 %	218442618
134	NC_011738	ATT	2	6	9735	9740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442618
135	NC_011738	AAT	2	6	9923	9928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442618
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264	NC_011738	A	7	7	17136	17142	100 %	0 %	0 %	0 %	218442625
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266	NC_011738	A	6	6	17230	17235	100 %	0 %	0 %	0 %	218442625
267	NC_011738	A	6	6	17268	17273	100 %	0 %	0 %	0 %	218442625
268	NC_011738	AAG	2	6	17308	17313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442625
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393	NC_011738	TAA	2	6	23010	23015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442628
394	NC_011738	AT	3	6	23020	23025	50 %	50 %	0 %	0 %	218442628
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